Week 2
Geplaatst
op 05 april 2019 om 09:33 uur
De tweede week van stage ging beginnen. De eerste week van stage hebben we
heel wat technieken gezien, maar hebben we vooral veel samen met andere mensen
gedaan, zodat we het een beetje konden leren. Deze week gingen we zelf wat meer
aan de slag. We hebben met het DNA dat we geïsoleerd hadden uit de
met-malaria-besmette rode bloedcellen, een PCR gedaan. Dit betekent eigenlijk
dat je specifieke stukjes van het DNA gaat vermenigvuldigen, zodat je ze daarna
beter kan gaan analyseren. Je gebruikt hiervoor zogenaamde ‘primers’, welke het
stukje DNA waar jij geïnteresseerd in bent, als het ware markeren, zodat je na
de PCR eindigt met heel veel kopieën van het stukje DNA. Deze primers moeten
een bepaalde concentratie hebben – we zijn dus bezig geweest om de primers op
te lossen en te verdunnen, zodat ze de goede concentratie kregen waar we de
PCRs mee konden uitvoeren. De PCR zijn we deze week een beetje gaan finetunen.
Het proces van de DNA vermenigvuldiging vindt namelijk plaats bij verschillende
temperaturen en je wil die temperatuur vinden, waarbij de vermenigvuldiging het
meest accuraat gebeurt, zodat je dus precies hetzelfde stukje DNA nog een keer
hebt. Nadat we de PCRs op verschillende temperaturen gedaan hadden, gingen we
de stukjes DNA op een gel laten ‘runnen’. Je moet hiervoor zelf een gel maken, waar
het DNA doorheen kan gaan bewegen. Het idee hierbij is dat de kleinere stukjes
DNA sneller hierdoor heen kunnen bewegen, dan de grotere stukken DNA. Het
stukje DNA waar ik in geïnteresseerd in was, heeft een bepaalde grootte die we
weten. Door een zogenaamde ‘ladder’ te gebruiken als controle, kan je bepalen
wat de grootte is van jouw stukje DNA, en dus grofweg of je het goede stukje
DNA verkregen hebt.
Buiten het werken in het lab, hebben we deze week natuurlijk ook weer
genoten van het mooie weer. Meestal zijn we rond 15.30-16.00 vrij en kunnen we
nog even genieten van de zon met ons drankje. Deze keer hadden we ook kunnen
regelen dat we de dinsdag vrij konden krijgen. We hadden namelijk gezien dat er
op dinsdags tripjes waren naar Rietvlei, een schijnbaar heel mooi nature
reserve. We waren alleen een beetje laat met boeken, en op het moment dat wij
hoorden dat we de dag vrij mochten, konden we de trip al niet meer boeken. We
hadden ervoor kunnen kiezen om dan toch maar naar de universiteit te gaan, maar
omdat onze primers er nog niet waren (die moesten besteld worden), konden we
toch niet veel doen, en besloten we dus maar zelf een tripje te plannen naar
Rietvlei. We wilden het liefst wel een guide erbij hebben, maar voor een guide
moest je twee weken van tevoren reserveren, wat dus niet meer ging. Het park
was om 5.30 open, dus we gingen maar zo vroeg mogelijk heen, zodat we hopelijk
met een al georganiseerde trip mee konden gaan. We stonden dus supervroeg op en
vetrokken al voor 5 uur naar Rietvlei. Echter, toen we daar aankwamen, bleek er
geen trip gepland te zijn… Ook kon je geen zelfstandige hikeroute doen, omdat
er blijkbaar hyena’s en andere jachtdieren rondliepen… Dit was ook niet vermeld
op de website helaas, en nu zaten we in alle vroegte op een nature reserve waar
we niks konden doen, omdat we ook geen auto bij ons hadden waarmee we de route
zelfstandig konden doen… Ook hier was weer geen WiFi spot aanwezig – dit was
dus wel echt iets waar we wat aan moesten veranderen, want we zaten hier nu dus
een beetje vast. Het was nog donker en dan wil je ook niet lopen naar een
andere plaats, plus de omgeving buiten het nature reserve was hier niet echt
veilig. Uiteindelijk heeft een vriendelijke werkneemster ons geholpen met het
internet en konden we een über terug regelen… We zijn toen naar Hatfield Plaza
gegaan, waar we bij Wimpy’s nog even een hele vieze Chai Latte maar een lekkere
wafel genomen hadden. We hebben even overwogen wat we dan zouden doen met de
dag – het was immers net 7 uur geweest en we hadden nog de hele dag voor ons.
We gingen kijken op internet of we misschien nog konden gaan paardrijden in
Groenkloof en dit scheen te kunnen. We namen een über naar Groenkloof – we
hadden geleerd van onze vorige keer en vroegen deze keer direct aan de über
chauffeur of hij ons ook op een gezet tijdstip weer op kon halen, zodat we ook
verzekerd waren van een ritje terug. Bij Groenkloof aangekomen, bleek dat we
niet konden paardrijden. Dit was een beetje teleurstellen, omdat het wel écht
op de site aangegeven stond – we kwamen tot de conclusie dat je gewoon niet
meer moet aannemen wat op de website staat, omdat dit dus al de derde keer was
dat het niet klopte… Enigszins chagrijnig begonnen we aan onze hike – het hiken
waren we nu wel een beetje beu en we baalden ook gewoon dat de dag niet zo liep
als gepland, maar we besloten er wel het mooiste van te maken. We gingen deze
keer maar voor de lange gele route, die ook weer hele mooie uitzichten bood.
Verder dan een paar lelijke struisvogels op afstand kwamen we echter niet, en
ook deze keer raakten we weer verdwaald. Uiteindelijk teruggekomen bij de
startplaats, kwamen we dezelfde werknemer als de vorige keer tegen. M’n puppy
oogjes werkten nu meteen en hij bood ons aan om ons rond te gaan rijden in zijn
auto! Dit maakte echt de hele dag goed! We hebben namelijk gereden op super
ruige weggetjes, maar we hebben ook echt ontzettend veel wilde dieren gezien –
verschillende kuddes wildebeesten, maar ook hele mooie zebra’s (met baby
zebra’s, waar we ook nog super dichtbij mee op de foto konden!), antilopen en
springbokken. We hebben nog gezocht naar de giraffen, maar hoe groot ze ook
zijn, deze konden we niet vinden. Toch vertrokken we met een voldaan gevoel uit
Groenkloof en was onze dag toch nog leuk geweest!
Reacties
Kirby
Geplaatst op 08 april 2019 om 22:24 uur
Super interessant DNA vermenigvuldigen! Fijn om een dagje vrij te zijn, jammer dat de dag anders verliep dan gepland. Toch wel tof dat de auto rit van die man, jullie dag goed heeft gemaakt!
|
Maartje
Geplaatst op 07 april 2019 om 12:26 uur
Interessant over de DNA en fijn dat jullie toch nog wat dieren kunnen zien.
|
Clayton
Geplaatst op 05 april 2019 om 19:28 uur
<3
|